原是生駒屋少主的山岡百介（關俊彥 配音），因著迷于奇聞怪談而放棄了祖業，成為一個云游四方的作家，收集各種怪談故事撰寫《巷說百物語最新電影。在一個雨夜，他遇到了一個神秘的三人組：擅長騙術的御行師又市先生（中尾隆圣 配音），擅長操縱玩偶的傀儡師阿銀小姐（小林沙苗 配音）以及擅長鳥寄的模仿師長耳先生（若本規夫 配音）。他們行蹤飄忽，隨時出現又隨時消失，他們現身之處往往流傳著神秘詭異的靈異事件。因緣巧合之下，百介跟隨他們進入了黑暗世界中，見證了一系列詭異的事件。而這些怪談故事，也就為他撰寫《百物語》提供了素材。百介所經歷的種種事件中，里面的鬼怪往往是日常生活中扭曲的人性所變成的。三人組用他們獨有的手段將那些人性罪惡暴露于人前。……