自9·11以來，人類社會在墮落和滅亡的道路上高歌猛最新電影。2013年，莫斯科、倫敦、上海、東京等國際大都會接連發生等級超越9·11的恐怖襲擊事件，世界局勢危在旦夕。圣火在東京一隅的少年島村喬（宮野真守 飾），其真實身份是編號為009的人造人，他誕生的初衷便是保護世界和平。如今消除了往昔記憶的他再也無法獨善其身，經過一系列的波折，終于和當年的伙伴們001伊凡·維斯基（玉川砂記子 配音）、002杰特·林格（小野大輔 配音）、003法蘭索娃·阿爾達努（齋藤千和 配音）、004艾柏特·海因利希（大川透 配音）、005索羅門·索尼亞（丹澤晃之 配音）、006張張胡（增岡太郎 配音）、007葛雷特·布林頓（吉野裕行 配音）會面。擁有超人一般能力的他們，面臨前所未有的挑戰……

故事發生在二十一世紀初年，一場浩大的災難讓“生府”取代了原有政府，成為了國家最高領導組潦草網。經過死亡的洗禮，人們開始格外重視生命的重要性，于是，政務在居民們體內植入了“WatchMe”設備，以檢測和介入他們的健康狀況，這也就意味著，身體不再是屬于個人的所有物，而是被列入了國家管理的范疇，自殺更是無可饒恕的重罪?！　§F慧圖安（澤城美雪 配音）、御冷彌迦（上田麗奈 配音）和零下堂吉安（洲崎綾 配音）是三位對現存制度產生了疑慮的少女，在彌迦的帶領下，她們準備自殺以挑戰制度，可是最終彌迦死了，計劃失敗。一晃眼多年過去，霧慧和吉安重逢，與此同時，全國各地發生了數千起集體自殺的案件，而這背后的真相和彌迦當年的死有著千絲萬縷的關聯。