某天，月島中央署轄區內某工作室突發爆炸事電影天堂。根據現場勘查的情況判斷，爆炸可能由煤氣泄漏而引發的。刑警系村聰（上川隆也飾）對現場遺留的殘骸碎片頗感興趣，他嘗試著將碎片復原，結果發現竟是一只香爐。雖然可能沒有什么直接聯系，不過系村還是將其送到供職于警視廳科搜研的村木繁（甲本雅裕飾）那里去做鑒定，意想不到的是遽然發現十分有趣的東西。未過多久，轄區內另一處也發生爆炸事件，并且導致出席某慶典的議員死亡。疑似的恐怖事件在警視廳引起震動，警方上上下下亂作一團。現場勘察的初步結果，再度發現了類似的香爐的殘骸碎片。撲朔迷離的真相逐漸浮出水面，可派的陰謀昭然若揭……

某天，月島中央署轄區內某工作室突發爆炸事電影天堂。根據現場勘查的情況判斷，爆炸可能由煤氣泄漏而引發的。刑警系村聰（上川隆也飾）對現場遺留的殘骸碎片頗感興趣，他嘗試著將碎片復原，結果發現竟是一只香爐。雖然可能沒有什么直接聯系，不過系村還是將其送到供職于警視廳科搜研的村木繁（甲本雅裕飾）那里去做鑒定，意想不到的是遽然發現十分有趣的東西。未過多久，轄區內另一處也發生爆炸事件，并且導致出席某慶典的議員死亡。疑似的恐怖事件在警視廳引起震動，警方上上下下亂作一團。現場勘察的初步結果，再度發現了類似的香爐的殘骸碎片。撲朔迷離的真相逐漸浮出水面，可派的陰謀昭然若揭……

某天，月島中央署轄區內某工作室突發爆炸事電影天堂。根據現場勘查的情況判斷，爆炸可能由煤氣泄漏而引發的。刑警系村聰（上川隆也飾）對現場遺留的殘骸碎片頗感興趣，他嘗試著將碎片復原，結果發現竟是一只香爐。雖然可能沒有什么直接聯系，不過系村還是將其送到供職于警視廳科搜研的村木繁（甲本雅裕飾）那里去做鑒定，意想不到的是遽然發現十分有趣的東西。未過多久，轄區內另一處也發生爆炸事件，并且導致出席某慶典的議員死亡。疑似的恐怖事件在警視廳引起震動，警方上上下下亂作一團。現場勘察的初步結果，再度發現了類似的香爐的殘骸碎片。撲朔迷離的真相逐漸浮出水面，可派的陰謀昭然若揭……

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2013年春季テレビ朝日日劇事件現場に殘された「遺留品」、被害者が殘した「被害品」が持つ意味を徹底的に探り、聲なき遺體が訴えたかったメッセージを代最新電視劇。事件そのものを解決するだけでなく、遺族の心情をも救う刑事?糸村聡（上川隆也）は、その優しさに溢れた行動、そして超マイペースで空気の読めない不思議キャラで、瞬く間に視聴者から愛される存在に！そんな愛すべき刑事?糸村の姿をまた見たい、という聲に応え、前シリーズ終了から約7カ月という異例の速さで『遺留捜査』が戻ってくる！放送枠は第1シリーズ放送時と同じ水曜21時枠、ドラマの舞臺は第2シリーズに引き続き月島中央署となる。前シリーズでは舞臺を警視庁捜査一課から下町?月島の所轄へ移すことで、江戸情緒と都會的雰囲気を加味。糸村の人間味あふれる優しさ、そんな彼が解き明かす事件の裏に隠された真実など、ハートフルでホロリとくる『遺留捜査』の世界観を大いに盛り上げた。新シリーズではその持ち味はそのままに、所轄という制限された立場でも必死に遺留品から真実を追い求めていく糸村の姿を、より丁寧に描寫。視聴者の心をさらに揺さぶる骨太ドラマを展開する！

周游神戶港的游覽船突然發生爆炸，犯罪者以船上的乘客作為人質，向該船的所屬公司“黑澤興產”勒索兩億日6080。偶然在場的警視廳月島署刑警系村（上川隆也），以不經意間發現的一張紙片為線索介入了這起事件。